O mercado magistral era basicamente inexistente no início das operações da Galena. Não havia um mercado formado, organizado, lucrativo, tampouco processos para ele. Além de formatar este segmento, uma das primeiras necessidades encontradas pela Galena foi a constituição de um sistema de qualidade. Por isso, ela criou o CIQ - Controle Integrado de Qualidade, envolvendo todas as operações e produtos da Galena através de um código aplicado às embalagens dos insumos distribuídos. Toda mercadoria distribuída pela Galena passou a ser identificada com o CIQ, que trazia todas as instruções de precauções de segurança, estocagem, ficha técnica constando lote, volume, fabricação, validade, peso bruto e conteúdo, devidamente cadastrados no sistema interno e na etiqueta aplicada às embalagens. O CIQ foi o primeiro o sistema de qualidade do mercado magistral, competência chave da Galena na distribuição de insumos farmacêuticos até hoje.